iPOP-UP en un coup d’œil
iPOP-UP agit pour la bioinformatique au sein de l’Université en de plusieurs manières. Notamment via de l’aide directe, en permettant un accès a un cluster de calcul, ou en ralliant la communauté de bioinformaticien·nes de l’UP
Communauté
iPOP-UP est une force structurante au sein du paysage bioinformatique de l’Université Paris Cité. Que ce soit en apportant de l’aide à des questions ponctuelles, en vous aidant à trouver vos futurs collaborateur·ices, ou en organisant des évènements autour de la bioinformatique. Les Bioinformatic meetings, par exemple, sont des réunions ouvertes à tous·tes, ou nous parlons de bioinformatique, plutôt que de la recherche qui en demande l’utilisation. Si vous souhaitez participer, ou si vous avez des suggestions d’évènements, n’hésitez pas à nous contacter.
Aide directe
Nous apportons également de l’aide directe soutenue à quelques équipes à la suite d’un appel à projet. Nous épaulons actuellement trois équipes différentes dans leurs analyses single nuclei, et profitons de pouvoir observer les besoin de plusieurs équipe dans le sujet pour établir des guidelines dans le traitement de telle données. D’autres appels à projet seront lancés pour aider d’autres équipes lorsque ces interventions seront terminées. Si vous voulez êtres sur d’être informer ou si vous avez besoin d’une aide ponctuelle, n’hésitez pas à nous contacter.
High Performance Cluster
Certaines études bioinformatiques requièrent beaucoup plus de puissance de calcul que ce que les ordinateurs présents en laboratoires peuvent fournir. Pour répondre à ce besoin, iPOP-UP s’est associé à RPBS afin de mettre en place un cluster de calcul.
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BiBs accompagne les personnels EDC dans leurs analyses bioinformatiques et biostatistiques, en favorisant leur montée en compétence. Nous développons et mettons à disposition des protocoles standardisés pour l’analyse de données NGS en épigénomique.
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