Club bioinfo
Le club iPOP-UP BioInfo rassemble des scientifiques qui souhaitent découvrir certaines approches et certains outils informatiques utilisés en génomique, en bio-informatique structurale et en bio-informatique d’images, et apprendre par la pratique sur place. Le club iPOP-UP BioInfo comprend l’Institut Jacques Monod (IJM), l’unité Épigénétique et destin cellulaire (EPC), l’Unité de biologie fonctionnelle et adaptative (BFA) et l’Institut Cochin.
Organisateurs du club iPOP-UP BioInfo
Yves Clément (IJM)
Bertrand Cosson (EPC)
Virginie Courtier (IJM)
Olivier Kirsh (EPC)
Nikos Konstantinides (IJM)
Samuel Murail (BFA)
Olivier Taboureau (BFA).
Si vous avez des questions concernant le club iPOP-UP BioInfo, veuillez envoyer un e-mail à Virginie Courtier ou Bertrand Cosson.
Le club iPOP-UP BioInfo se réunit environ une fois par mois, le mardi de 12h30 à 13h30, principalement dans la salle de séminaire François Jacob (Institut Jacques Monod, 15 rue Hélène Brion 75013) ou dans la salle RH73 (Bâtiment Lamarck, 35 rue Hélène Brion 75013). Les personnes travaillant à l’Institut Cochin peuvent participer via Zoom. Les réunions se déroulent en anglais. Une collation légère est fournie. Pour la plupart des sessions, veuillez apporter votre boisson et votre ordinateur portable. Il peut s’agir d’un ordinateur Linux, Mac ou Windows. Nous vous informerons à l’avance s’il s’agit d’une session pratique, d’une présentation ou d’une discussion.
Les sessions du BioInfo Club précédemment organisées par Michael Lang (en 2014-2015), Virginie Courtier et ses collègues (en 2011-2014 et 2018-2020) sont disponibles ici.
Next sessions
(12:30-13:30, 2nd Tuesday of each month with a few exceptions)
14 Oct 2025, 12:30-13:30 (room F. Jacob) GENERAL PRESENTATION – FOR ALL
Using AI for readnig/analyzing papers (Pierre Kerner and Marianne Malartre)
18 Nov 2025, 12:30-13:30 (room F. Jacob)
Sycomia: Advanced -omics analyses for translational research (Louis Chauvière)
Sycomia is a bioinformatics services company created by an ancient UPC post-doc. Sycomia develops comprehensive bioinformatics solutions to accelerate translational research in life sciences. We provide end-to-end services for single-cell, spatial, and multi-omics data analysis with streamlined workflows and robust analytical pipelines. A particular focus will be presented on our circulating tumor DNA (ctDNA) developments: variant detection, tumor burden monitoring, and predictive algorithms for therapeutic monitoring. We bridge the gap between complex -omics data and research applications, supporting research teams in translating discoveries into actionable insights that advance scientific understanding and therapeutic development.
9 Dec 2025
13 Jan 2026
10 Feb 2026
10 March 2026
14 Apr 2026
Past sessions
9 Sept 2025, 12:30-13:30 (room F. Jacob) GENERAL PRESENTATION – FOR ALL
Revolutionizing Protein Science: AlphaFold’s Impact and Beyond (Samuel Murail) Presentation
10 June 2025, 1-2pm (room F. Jacob) COMPUTER – ADVANCED
Building Bioinformatics Capacity at Cochin: New Platform Overview & GPU-Powered Single-Cell Analysis
Benjamin Saintpierre, BIOINFORMAT’IC platform, Cochin Institute
Possible sessions for the future:
Marc Baaden (IBPC), molecular dynamics, membrane proteins, virtual reality
Jessica Andreani ou Raphael Guerois (I2BC), Structural Bioinformatics, Protein Interaction
Anne Lopes (I2BC) de novo emerged gene prediction
Matthieu Montes, virtual screening