iPOP-UP en un coup d’œil
iPOP-UP accompagne les chercheurs dans l’analyse des données omiques complexes (génomique, transcriptomique, protéomique) en proposant des formations, un soutien technique personnalisé et l’accès à un cluster de calcul haute performance. En fédérant les expertises, iPOP-UP renforce les synergies entre équipes pour des projets de biologie intégrative innovants, tout en consolidant la communauté des bioinformaticien·nes d’Université Paris Cité.

Communauté
iPOP-UP est une force structurante au sein du paysage bioinformatique de l’Université Paris Cité. Que ce soit en apportant de l’aide à des questions ponctuelles, en vous aidant à trouver vos futurs collaborateur·ices, ou en organisant des évènements autour de la bioinformatique. Les Bioinformatic meetings, par exemple, sont des réunions ouvertes à tous·tes, où nous parlons de bioinformatique, plutôt que de la recherche qui en demande l’utilisation. Si vous souhaitez participer, ou si vous avez des suggestions d’évènements, n’hésitez pas à nous contacter.
High Performance Cluster
Certaines études bioinformatiques requièrent beaucoup plus de puissance de calcul que ce que les ordinateurs présents en laboratoires peuvent fournir. Pour répondre à ce besoin, iPOP-UP s’est associé à RPBS afin de mettre en place un cluster de calcul.
Analyses de Ribosome Profiling
Les plateformes iPOP-UP et Genom’ic unissent leurs expertises pour proposer un service complet de ribosome profiling, une technologie avancée permettant d’étudier la traduction des ARNm à l’échelle du génome. Cette approche révèle les régions codantes actives, ainsi que les mécanismes de régulation de la traduction, offrant des perspectives uniques pour vos projets de recherche.
Genom’ic assure les dernières étapes de préparation des échantillons, en s’appuyant sur des protocoles éprouvés et une expertise technique de haut niveau.
iPOP-UP complète ce service en prenant en charge l’analyse bioinformatique des données générées, incluant l’alignement, l’identification des zones traduites et l’interprétation fonctionnelle.
Ensemble, les deux plateformes offrent un accompagnement personnalisé, de la conception du projet jusqu’à l’interprétation des résultats. Cette collaboration s’adresse aux équipes de recherche souhaitant explorer le traductome et les mécanismes de traduction. Pour en savoir plus ou initier un projet, contactez nous !
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